In der Jenaplan Schule Neukölln lernen die Kinder in jahrgangsgemischten Stammgruppen. In der kleinen Stammgruppe sind die Jahrgänge 1-3 zusammen und in der großen Stammgruppe die Schüler*innen der 4-6 Jahrgangsstufe. Die Stammgruppe ist die Kerngruppe, dort sind sie zusammen mit ihren Mitschüler*innen und werden von ihrer Stammgruppenlehrer*in beim Lernen begleitet. Die meisten Unterrichtsfächer werden in der Stammgruppe unterrichtet. Dort wird aber auch gespielt und es werden gemeinsame Projekte geplant. Neue Ideen und Arbeitsergebnisse werden im Kreis am Montag und am Freitag entwickelt und präsentiert, Probleme besprochen.